巴塞罗那
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伊涅斯塔出身于加泰罗尼亚球会巴塞隆拿，于2002年10月被当时教练范加尔挑中，首次代表巴塞隆拿一队出场，在欧联中作客对比利时的布鲁日。在荷兰人弗兰克·里杰卡尔德出任主教练后，他上场时间持续增加，水平也大有提高。2005-2006赛季，由于球队在国内联赛和欧冠两线作战以及巴塞隆拿不断有中场球员受伤，得到了更多的首发机会。尤其是欧冠中，挑战意大利球会AC米兰的两场比赛担任防守中场，冻结了对方中场安德烈亚·皮尔洛的进攻组织，并在当月入选当月欧洲最佳阵容。在对阵英格兰球队阿森纳决赛中，下半场替补出场，被誉为改变了比赛结果的关键人物之一。
2009年开始，在当时的领队瓜迪奥拉带领下，巴塞罗那在国内外的赛事中横扫，其中在09年实现“六冠王”及2011年实现“五冠王”的赛季中，伊涅斯塔是重要功臣之一。2009年的欧联四强，对切尔西在最后时刻，攻入关键扳平球，成功带领球队进入决赛。他与哈维搭挡中路更被誉为是当代最稳健、最令欧洲列强恐惧的一条中场线，被外界评为只要他们两个在场上，就可以产生1+1=3的化学反应。
2018年4月27日，伊涅斯塔宣布今季西甲球季结束后，将会完约离开巴塞隆拿，结束22年巴塞隆拿球员生涯。
神户胜利船
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伊涅斯塔本来首选是去中国(重庆)掏金，但受限于重庆对于球队撒天价引进外援的能力有限(加上中超开始限制外援薪金)，未能达成共识的情况下于2018年5月加入日本J联赛的神户胜利船，签约三年、年薪2500万欧元，成为当时全球第4高薪的足球员。
2020年1月1日，伊涅斯塔以队长身份捧起日本天皇杯的奖杯。
2021年5月11日，伊涅斯塔与神户胜利船签署了一份续约合同，让他在俱乐部再留多两个赛季[3]。
2023年5月, 伊涅斯塔召开记者会, 宣布与神户胜利船于7月1日提前结束合同并出席最后一场日职比赛,但仍未决定是否退役 。
转战阿联酋
2023年8月9日，酋长FC官方正式宣布伊涅斯塔加盟球队，双方将签约一年至2024年6月，并包含续约一年的选项。
2024年10月7日，伊涅斯塔宣布正式退役[4]。